W II Liceum Ogólnokształcącym im. Marii Konopnickiej w Zamościu systematycznie odbywają się warsztaty profilaktyczne adresowane do uczniów klas I–IV.
Tego rodzaju działania mają na celu przede wszystkim promowanie zdrowego stylu życia oraz kształtowanie ważnych umiejętności życiowych, w zakresie budowania równowagi psychicznej oraz konstruktywnego i stabilnego systemu wartości. Zajęcia te służą wszechstronnemu wspomaganiu rozwoju ucznia, wzmacnianiu poczucia własnej wartości, radzeniu sobie ze stresem i presją rówieśniczą, rozwijaniu postaw asertywnych. Podczas warsztatów przekazywane są również informacje o konsekwencjach zażywania środków uzależniających.
Warsztaty profilaktyczne są prowadzone przez psychologów, terapeutów, jak i nauczycieli. Zajęcia te są finansowane ze środków Urzędu Miasta Zamość.